| 序号 | 名称 | 类型 | 合作单位 |
| 1 | 昆山蔬菜产业研究院 | 特色产业基地 | 昆山市城区农副产品实业有限公司 |
| 2 | 句容草坪研究院 | 特色产业基地 | 句容市后白镇人民政府 |
| 3 | 现代牧业奶牛产业技术研究院 | 特色产业基地 | 现代牧业集团有限公司 |
| 4 | 苏州水稻种子技术研究院 | 特色产业基地 | 苏州市农业农村局 |
| 5 | 龙昌动保肝脏健康与稳态调控研究院 | 特色产业基地 | 山东龙昌动物保健品有限公司 |
| 6 | 沈阳泰尔兰牧业肉牛产业技术研究院 | 特色产业基地 | 沈阳泰尔兰牧业有限公司 |
| 7 | 南京云几茶产业研究院 | 特色产业基地 | 南京云几文化产业发展有限公司 |
| 8 | 艾津种子健康技术研究院 | 特色产业基地 | 江苏艾津作物科技集团有限公司 |
| 9 | 烟台动物保健品产业研究院 | 特色产业基地 | 烟台金海药业有限公司 |
| 10 | 特殊需求肉类预制菜联合创新中心 | 特色产业基地 | 江苏百汇农业发展有限公 江苏省泰兴现代农业产业园 |
| 11 | 普宁青梅研究院 | 特色产业基地 | 潮汕职业技术学院 |
| 12 | 祁门县现代农业产业研究院 | 特色产业基地 | 祁门县人民政府 |
| 13 | （智飞生物）单分子合成生物学产业研究院 | 特色产业基地 | 江西智飞生物有限公司 |
| 14 | 山东海创Barf自然食谱产业研究院 | 特色产业基地 | 山东海创工贸有限公司 |
| 15 | 山东帅克宠物健康产业研究院 | 特色产业基地 | 山东帅克宠物用品股份有限公司 |
| 16 | 加德华产业研究院 | 特色产业基地 | 江苏加德华农业科技研究院 有限公司 |
| 17 | 植物表型产业研究院 | 特色产业基地 | 南京秾云科技有限公司 |
| 18 | 光明研究院 | 特色产业基地 | 光明农业发展（集团）有限公司 |
| 19 | 劲仔食品鹌鹑产业研究院 | 特色产业基地 | 平江县劲仔食品有限公司 |
| 20 | 合肥科晶AI生物模型产业研究院 | 特色产业基地 | 合肥科晶生物技术有限公司 |
| 21 | 常州市天宁区乡村振兴研究院 | 特色产业基地 | 江苏勤业农业科技有限公 司常州市天宁区人民政府 |
| 22 | 安佑集团动物营养与健康产业研究院 | 特色产业基地 | 安佑生物科技集团股份有限公司 |
| 23 | 丰县果业研究院 | 特色产业基地 | 丰县人民政府 |
| 24 | 反刍动物健康研究院 | 特色产业基地 | 动康（南京）生命科学技术有限公司 |
| 25 | 托普云农-南京农业大学农业生物表型研究院 | 特色产业基地 | 浙江托普云农科技股份有限公司 |
| 26 | 宁陵县梨产业研究院 | 特色产业基地 | 宁陵县人民政府 |
| 27 | 神奇毛侠宠物干细胞健康产业研究院 | 特色产业基地 | 神奇毛侠宠物（上海）有限公司 |
| 28 | 治多县国营牧场高原牲畜研究院 | 特色产业基地 | 治多县国营牧场 |
| 29 | 天然小分子农药产业研究院 | 特色产业基地 | 四川国光农化股份有限公司 四川润尔科技有限公司（甲方全资子公司） |
| 30 | 衢州特色产业研究院 | 特色产业基地 | 衢州市农业林业科学院 |
| 31 | 南农安泰生猪健康与肉品安全合作创新研究院 | 特色产业基地 | 安徽安泰农业开发有限责任公司 |
| 32 | 青州产业研究院 | 特色产业基地 | 青州市人民政府 |
| 33 | 南京吉盛澳玛小核酸产业研究院 | 特色产业基地 | 南京吉盛澳玛生物医药有限公司 |
| 34 | 欧雅德牧生物饲料产业研究院 | 特色产业基地 | 上海欧雅德牧生物技术有限公司 |
| 35 | 朝向草业科技产业研究院 | 特色产业基地 | 深圳市朝向集团有限公司 |
| 36 | 江苏扬农化工股份有限公司农药产业研究院 | 特色产业基地 | 江苏扬农化工股份有限公司 |
| 37 | 山东微研微生物合成色素产业研究院 | 特色产业基地 | 山东微研生物科技有限公司 |
| 38 | 新沂葡萄产业研究院 | 特色产业基地 | 新沂市农业农村局 |
| 39 | 新沂稻米产业研究院 | 特色产业基地 | 新沂市农业农村局 |
